Ne postoji priznata metoda za klasifikaciju pigmenata. Razlog je taj što postoji mnogo vrsta pigmenata, kemijski sastav je vrlo različit, a upotreba je različita. Stoga, koja metoda nije idealna za klasifikaciju.
Uobičajena metoda klasifikacije je dijeljenje pigmenata u anorganske i organske pigmente prema njihovom kemijskom sastavu. Što se tiče performansi, anorganski pigmenti imaju dobru svjetlosnu postojanost, otpornost na toplinu i snažnu moć skrivanja, ali hromatogram nije vrlo potpun, snaga bojenja je niska, svjetlina boje je loša, a neke metalne soli i oksidi su toksičniji. Organski pigmenti imaju raznoliku strukturu, kompletne hromatograme, svijetle i čiste nijanse i snažnu moć bojenja, ali imaju lošu otpornost na svjetlost, vremensku otpornost i hemijsku stabilnost te su skuplji.
Fluorescentni pigmenti se dijele na anorganske fluorescentne pigmente (poput fluorescentnih pigmenata koji se koriste u fluorescentnim lampama i fluorescentnim bojama protiv krivotvorenja) i organske fluorescentne pigmente (poznate i kao fluorescentni pigmenti dnevnog svjetla): fluorescentna svojstva mogu imati samo supstance specifične hemijske strukture. Međutim, sami ovi fluorescentni bojili često imaju svojstvene nedostatke u otpornosti na svjetlost i otpornost na otapala. Jedan od načina za prevladavanje ovih svojstvenih nedostataka je spajanje u okvir polimernih materijala kemijskim ili fizičkim metodama, a zatim daljnja prerada u pigmente. Polimerni materijal korišten u tu svrhu ne samo da djeluje kao rastvarač za fluorescentnu boju, već također pruža zaštitu za fluorescentnu boju, čime fluorescentnoj boji daje bolju otpornost na svjetlost i otpornost na rastvarače.
